太长不读版
- 治本的方法，服务器安装pango, 之后重新编译R语言
- 治标的方法，在R的配置文件中增加
options(bitmapType='cairo')
服务器上装完R语言之后，发现自己的PNG函数无法正常调用，始终会出现一个X11连接失败的错误。
> png('ab.png')
Error in .External2(C_X11, paste0("png::", filename), g$width, g$height, :
unable to start device PNG
In addition: Warning message:
In png("ab.png") : unable to open connection to X11 display ''
使用 capabilities查询之后，的确是没有启用X11。
> capabilities()
jpeg png tiff tcltk X11 aqua
TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE FALSE
http/ftp sockets libxml fifo cledit iconv
TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE TRUE
NLS Rprof profmem cairo ICU long.double
TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE TRUE
libcurl
TRUE
回溯到我源代码的配置过程，发现配置项目包括X11的界面支持，Interfaces supported:X11, tcltk. 但是我思索了下，这个X11支持指的应该是Linux的图形界面下的R，而不是终端的R，我的直觉告诉我，这个信息应该是和我们的报错无关了。
之后，我又去查了下其他资料，谢益辉提到这可能是png函数的type参数选择出现了问题，也就是下面这段函数
if (missing(type))
type <- getOption("bitmapType")
进一步这个bitmapType选项的设置又和 grDevices:::.onLoad函数中的.Call(C_cairoProps, 2L)有关。其中.Call是R语言调用C语言编写函数的一种方式，回溯到对应的C代码(代码位置为src/library/grDevices/src/init.c)
#ifndef _WIN32
/* This really belongs with the X11 module, but it is about devices */
static SEXP cairoProps(SEXP in)
{
int which = asInteger(in);
if(which == 1)
return ScalarLogical(
#ifdef HAVE_WORKING_CAIRO
1
#else
0
#endif
);
else if(which == 2)
return ScalarLogical(
#ifdef HAVE_PANGOCAIRO
1
#else
0
#endif
);
return R_NilValue;
}
#endif
还好，我略懂一些C语言，发现这个输出结果又和变量 HAVE_PANGOCAIRO 有关。 搜索R源代码中所有和HAVE_PANGOCAIRO有关的内容，发现在configure有相关记录，对应的逻辑判断语句如下
if test "x${r_cv_has_pangocairo}" = xyes; then
printf "%s\n" "#define HAVE_PANGOCAIRO 1" >>confdefs.h
fi
进一步，我们在configure中查找 r_cv_has_pangocairo, 找到如下的判断语句
else $as_nop
if "${PKG_CONFIG}" --exists pangocairo; then
r_cv_has_pangocairo="yes"
else
r_cv_has_pangocairo="no"
fi
fi
那看来有可能是pangocairo这个库出现了问题。使用下列代码在我的服务器上测试，发现输出是no, 说明的确没有安装。
/bin/pkg-config --exists pangocairo && echo "yes" || echo "no"
我尝试着用下述代码安装pango
# CentOS
sudo yum install pango-devel pango libpng-devel
# ubuntu
sudo apt install libpango-1.0-0
对R进行重新编译安装，发现 getOption("bitmapType") 得到的结果是cairo，符合预期了。
当然，你可能也不需要那么麻烦的方法，还有一种简单的思路是在 ~/.Rprofile中加入这一行，手动指定cairo。
options(bitmapType='cairo')
注意: 直接用apt/yum安装的R， getOption("bitmapType") 输出直接是 cairo.
参考资料
