2019-12-09

生信软件工具箱

Hi-C数据可视化-组装角度

从组装角度来看，我更关注如何展示多条contig之间的互作关系

2019-12-05

生信软件工具箱

SALSA:基于Hi-C辅助组装长读长组装结果

SALSA应该是第一个用GFA作为Hi-C辅组组装输入信息的工具吧

2019-11-02

生信软件工具箱

使用LACHESIS利用HiC数据进行基因组组装

亲测，不推荐

2019-10-31

生信软件工具箱

ALLHiC: 辅助组装简单的二倍体基因组

简单基因组也可以试试ALlHiC哦

2019-10-31

生信软件工具箱

ALLHiC续: 如何构建Allele.ctg.table

关于ALLHiC构建Allele.ctg.table的补充

2019-10-29

生信软件工具箱

使用ALLHiC基于HiC数据辅助基因组组装

ALLHiC, 高杂合基因组和多倍体物种的HiC辅助组装利器

2019-08-27

生信软件工具箱

HiC-Pro: Hi-C数据预处理高效工具

HiC-Pro是一个高效率的Hi-C数据预处理工具，能够应用于dilution Hi-C, in situ Hi-C, DNase Hi-C, Micro-C, capture-C, capture Hi-C 和 HiChip 这些数据。

2019-08-26

生信软件工具箱

利用3D-DNA流程组装基因组

一个简单好用的工具，就是个人觉得代码写的不好，有时间优化下吧

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SALSA:基于Hi-C辅助组装长读长组装结果

使用LACHESIS利用HiC数据进行基因组组装

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