chromVAR: 从单细胞表观数据中推断转录因子相关开放区域
chromVAR是一个用于分析稀疏染色质开放的R包。chromVAR的输入文件包括，ATAC-seq处理后的fragments文件（过滤重复和低质量数据）, DNAse-seq实验结果，以及基因组注释（例如motif位置）
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一个简单的小工具
在Linux系统中，除RStudio商业版外，默认仅支持单一R版本。本文介绍如何通过VSCode结合Conda，实现多个R版本的共存。首先安装Miniforge作为基础环境，配置Conda镜像以加速下载。接着创建不同的R环境并安装必要的R包，通过Conda-Forge管理依赖。最后，配置VSCode连接远程服务器并使用Jupyter插件选择对应的R内核。此方法灵活高效，适用于需要多版本R环境的开发与研究需求。
类似于部署NextChat
还是拥抱scanpy生态吧
顺应时代吧