使用RaGOO将基因组提升至染色体水平
基因组学  生信软件工具箱 

使用RaGOO将基因组提升至染色体水平

辅助组装的一个神器
阅读更多
使用Purge_dups去冗余序列
生信软件工具箱 

使用Purge_dups去冗余序列

一款速度更快的去冗余软件
阅读更多
生信软件工具箱 

Hi-C数据可视化-组装角度

从组装角度来看，我更关注如何展示多条contig之间的互作关系
阅读更多
Canu的graph和contig生成过程
生信软件工具箱 

Canu的graph和contig生成过程

关于Canu软件的一些深入探索
阅读更多
SALSA:基于Hi-C辅助组装长读长组装结果
生信软件工具箱 

SALSA:基于Hi-C辅助组装长读长组装结果

SALSA应该是第一个用GFA作为Hi-C辅组组装输入信息的工具吧
阅读更多
使用LACHESIS利用HiC数据进行基因组组装
生信软件工具箱 

使用LACHESIS利用HiC数据进行基因组组装

亲测，不推荐
阅读更多
ALLHiC: 辅助组装简单的二倍体基因组
生信软件工具箱 

ALLHiC: 辅助组装简单的二倍体基因组

简单基因组也可以试试ALlHiC哦
阅读更多
ALLHiC续: 如何构建Allele.ctg.table
生信软件工具箱 

ALLHiC续: 如何构建Allele.ctg.table

关于ALLHiC构建Allele.ctg.table的补充
阅读更多
使用ALLHiC基于HiC数据辅助基因组组装
生信软件工具箱 

使用ALLHiC基于HiC数据辅助基因组组装

ALLHiC, 高杂合基因组和多倍体物种的HiC辅助组装利器
阅读更多
生信软件工具箱 

使用nextpolish对三代组装进行polish

使用NextPolish对三代组装结果进行polish
阅读更多
关注我

分类

标签云

基因组注释 学习笔记 R 其他 Docker 容器 统计学 随便 GO Linux命令行 数据下载 大语言模型 并行 AWS SRA prompt engineer GPT HTS h WSL 环境配置 hash 源码解读 基因组 biocondutor Web开发 比较基因组学 系统发育 conda 深度学习 自然语言 随笔 SSH MacOS 读书 编程语言 MSVC MSCV QT 小技巧 爬虫 MAKER typora BioNano PBMC 数据挖掘 算法 C/C++ 遗传定位 Zotero 文献 坚果云 服务器 基因家族 JCVI CIRCOS 序列比对 samtools 流程工具 Hi-C 注释 重复序列 TCGA 差异分析 单细胞 Perl 软件安装 转录组 水稻 GitHub 组装 ChIP-seq 数据结构 表观组 Seurat BigWig ATAC-seq 可视化 字符串处理 NGS 正则表达式 环境变量 网站搭建

链接

最新文章

标签

基因组注释 1
学习笔记 0
R 0
其他 1
Docker 1
容器 1
统计学 2
随便 0
GO 1
Linux命令行 1
数据下载 1
大语言模型 3
并行 1
AWS 1
SRA 1
prompt engineer 1
GPT 1
HTS 1
h 0
WSL 1
环境配置 1
hash 1
源码解读 2
基因组 5
biocondutor 1
Web开发 2
比较基因组学 2
系统发育 3
conda 2
深度学习 3
自然语言 2
随笔 9
SSH 1
MacOS 7
读书 2
编程语言 2
MSVC 1
MSCV 0
QT 1
小技巧 11
爬虫 1
MAKER 5
typora 1
BioNano 1
PBMC 1
数据挖掘 3
算法 4
C/C++ 22
遗传定位 3
Zotero 2
文献 2
坚果云 2
服务器 5
基因家族 3
JCVI 4
CIRCOS 5
序列比对 3
samtools 1
流程工具 13
Hi-C 8
注释 14
重复序列 6
TCGA 1
差异分析 2
单细胞 29
Perl 1
软件安装 11
转录组 11
水稻 2
GitHub 3
组装 21
ChIP-seq 2
数据结构 10
表观组 3
Seurat 3
BigWig 1
ATAC-seq 20
可视化 13
字符串处理 1
NGS 3
正则表达式 2
环境变量 2
网站搭建 1

最新文章

标签

基因组注释 1
学习笔记 0
R 0
其他 1
Docker 1
容器 1
统计学 2
随便 0
GO 1
Linux命令行 1
数据下载 1
大语言模型 3
并行 1
AWS 1
SRA 1
prompt engineer 1
GPT 1
HTS 1
h 0
WSL 1
环境配置 1
hash 1
源码解读 2
基因组 5
biocondutor 1
Web开发 2
比较基因组学 2
系统发育 3
conda 2
深度学习 3
自然语言 2
随笔 9
SSH 1
MacOS 7
读书 2
编程语言 2
MSVC 1
MSCV 0
QT 1
小技巧 11
爬虫 1
MAKER 5
typora 1
BioNano 1
PBMC 1
数据挖掘 3
算法 4
C/C++ 22
遗传定位 3
Zotero 2
文献 2
坚果云 2
服务器 5
基因家族 3
JCVI 4
CIRCOS 5
序列比对 3
samtools 1
流程工具 13
Hi-C 8
注释 14
重复序列 6
TCGA 1
差异分析 2
单细胞 29
Perl 1
软件安装 11
转录组 11
水稻 2
GitHub 3
组装 21
ChIP-seq 2
数据结构 10
表观组 3
Seurat 3
BigWig 1
ATAC-seq 20
可视化 13
字符串处理 1
NGS 3
正则表达式 2
环境变量 2
网站搭建 1
Your browser is out-of-date!

Update your browser to view this website correctly. Update my browser now

×

最新文章
为什么M芯片的Mac不应该去装intel版的R

顺应时代吧
使用NextChat在本地使用Claude和ChatGPT

只需要3步
Helixer解决了我的基因组结构注释难题

这个模型太强了，强烈推荐
白话统计学习笔记：我们应该使用什么统计模型？

想清了问题，模型也就有了
动物如何准备pyscenic所需的cistarget数据库

非模式物种的动物还算简单
分类
其他 others
Linux linux
生信软件工具箱 biotools
R r
文章重现 reproduce
文献阅读 literature
数据结构与算法 algo
数据科学 data_science
基因组学 genome
转录组学 rna-seq
Python python
C++ cpp
Rust rust
Java java
基因调控 regulatory
标签
基因组注释 基因组注释
学习笔记 学习笔记
R r
其他 其他
Docker docker
容器 容器
统计学 统计学
随便 随便
GO go
Linux命令行 linux命令行
数据下载 数据下载
大语言模型 大语言模型
并行 并行
AWS aws
SRA sra
prompt engineer promptengineer
GPT gpt
HTS hts
h h
WSL wsl
环境配置 环境配置
hash hash
源码解读 源码解读
基因组 基因组
biocondutor biocondutor
Web开发 web开发
比较基因组学 比较基因组学
系统发育 系统发育
conda conda
深度学习 深度学习
自然语言 自然语言
随笔 随笔
SSH ssh
MacOS macos
读书 读书
编程语言 编程语言
MSVC msvc
MSCV mscv
QT qt
小技巧 小技巧
爬虫 爬虫
MAKER maker
typora typora
BioNano bionano
PBMC pbmc
数据挖掘 data_mining
算法 algorithnm
C/C++ c
遗传定位 mapping
Zotero zotero
文献 paper
坚果云 jianguo_cloud
服务器 server
基因家族 gene_family
JCVI jcvi
CIRCOS circos
序列比对 alignment
samtools samtools
流程工具 pipeline
Hi-C hi-c
注释 annotation
重复序列 repeat
TCGA tcga
差异分析 DGE_analysis
单细胞 singlecell
Perl perl
软件安装 software-installation
转录组 transcriptome
水稻 rice
GitHub github
组装 assembly
ChIP-seq chip-seq
数据结构 data_structure
表观组 epigenomics
Seurat seurat
BigWig bigwig
ATAC-seq atac-seq
可视化 visualization
字符串处理 strings-process
NGS ngs
正则表达式 regrex
环境变量 environment-variable
网站搭建 website-build