使用Purge_dups去冗余序列

一款速度更快的去冗余软件

Hi-C数据可视化-组装角度

从组装角度来看,我更关注如何展示多条contig之间的互作关系

Canu的graph和contig生成过程

关于Canu软件的一些深入探索

SALSA:基于Hi-C辅助组装长读长组装结果

SALSA应该是第一个用GFA作为Hi-C辅组组装输入信息的工具吧

ALLHiC: 辅助组装简单的二倍体基因组

简单基因组也可以试试ALlHiC哦

ALLHiC续: 如何构建Allele.ctg.table

关于ALLHiC构建Allele.ctg.table的补充

使用ALLHiC基于HiC数据辅助基因组组装

ALLHiC, 高杂合基因组和多倍体物种的HiC辅助组装利器

使用nextpolish对三代组装进行polish

使用NextPolish对三代组装结果进行polish
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