转录组学 

如何使用GMAP/GSNAP进行转录组序列比对

GMAP的简单用法
阅读更多
MAKER避免重复运算
基因组学 

MAKER避免重复运算

如何避免不必要的运算
阅读更多
MAKER训练SNAP基因模型
基因组学 

MAKER训练SNAP基因模型

SNAP模型的训练三要素，基因组，转录本和蛋白序列
阅读更多
MAKER配置文件详解
基因组学 

MAKER配置文件详解

MAKER的配置文件介绍
阅读更多
MAKER的并行化初探
基因组学 

MAKER的并行化初探

MAKER到底有没有在摸鱼
阅读更多
Apollo安装笔记
生信软件工具箱 

Apollo安装笔记

注释调整工具
阅读更多
如何对基因组序列进行注释
生信软件工具箱 

如何对基因组序列进行注释

如何注释你的基因组？
阅读更多
生信软件工具箱 

使用BRAKER2进行基因组注释

基因组注释的一个流程化工具
阅读更多
生信软件工具箱 

使用Swiss-Prot根据同源基因进行注释

使用UniProt上的dat信息对基因进行功能注释
阅读更多
生信软件工具箱 

使用TransDecoder寻找转录本中的编码区

TransDecoder能够从转录本序列中鉴定候选编码区。这些转录本序列可以来自于Trinity的从头组装，或者来自于Cufflinks或者StringTie的组装结果。
阅读更多
关注我

分类

标签云

基因组注释 学习笔记 R 其他 Docker 容器 统计学 随便 GO Linux命令行 数据下载 大语言模型 并行 AWS SRA prompt engineer GPT HTS h WSL 环境配置 hash 源码解读 基因组 biocondutor Web开发 比较基因组学 系统发育 conda 深度学习 自然语言 随笔 SSH MacOS 读书 编程语言 MSVC MSCV QT 小技巧 爬虫 MAKER typora BioNano PBMC 数据挖掘 算法 C/C++ 遗传定位 Zotero 文献 坚果云 服务器 基因家族 JCVI CIRCOS 序列比对 samtools 流程工具 Hi-C 注释 重复序列 TCGA 差异分析 单细胞 Perl 软件安装 转录组 水稻 GitHub 组装 ChIP-seq 数据结构 表观组 Seurat BigWig ATAC-seq 可视化 字符串处理 NGS 正则表达式 环境变量 网站搭建

链接

最新文章

标签

基因组注释 1
学习笔记 0
R 0
其他 1
Docker 1
容器 1
统计学 2
随便 0
GO 1
Linux命令行 1
数据下载 1
大语言模型 3
并行 1
AWS 1
SRA 1
prompt engineer 1
GPT 1
HTS 1
h 0
WSL 1
环境配置 1
hash 1
源码解读 2
基因组 5
biocondutor 1
Web开发 2
比较基因组学 2
系统发育 3
conda 2
深度学习 3
自然语言 2
随笔 9
SSH 1
MacOS 7
读书 2
编程语言 2
MSVC 1
MSCV 0
QT 1
小技巧 11
爬虫 1
MAKER 5
typora 1
BioNano 1
PBMC 1
数据挖掘 3
算法 4
C/C++ 22
遗传定位 3
Zotero 2
文献 2
坚果云 2
服务器 5
基因家族 3
JCVI 4
CIRCOS 5
序列比对 3
samtools 1
流程工具 13
Hi-C 8
注释 14
重复序列 6
TCGA 1
差异分析 2
单细胞 29
Perl 1
软件安装 11
转录组 11
水稻 2
GitHub 3
组装 21
ChIP-seq 2
数据结构 10
表观组 3
Seurat 3
BigWig 1
ATAC-seq 20
可视化 13
字符串处理 1
NGS 3
正则表达式 2
环境变量 2
网站搭建 1

最新文章

标签

基因组注释 1
学习笔记 0
R 0
其他 1
Docker 1
容器 1
统计学 2
随便 0
GO 1
Linux命令行 1
数据下载 1
大语言模型 3
并行 1
AWS 1
SRA 1
prompt engineer 1
GPT 1
HTS 1
h 0
WSL 1
环境配置 1
hash 1
源码解读 2
基因组 5
biocondutor 1
Web开发 2
比较基因组学 2
系统发育 3
conda 2
深度学习 3
自然语言 2
随笔 9
SSH 1
MacOS 7
读书 2
编程语言 2
MSVC 1
MSCV 0
QT 1
小技巧 11
爬虫 1
MAKER 5
typora 1
BioNano 1
PBMC 1
数据挖掘 3
算法 4
C/C++ 22
遗传定位 3
Zotero 2
文献 2
坚果云 2
服务器 5
基因家族 3
JCVI 4
CIRCOS 5
序列比对 3
samtools 1
流程工具 13
Hi-C 8
注释 14
重复序列 6
TCGA 1
差异分析 2
单细胞 29
Perl 1
软件安装 11
转录组 11
水稻 2
GitHub 3
组装 21
ChIP-seq 2
数据结构 10
表观组 3
Seurat 3
BigWig 1
ATAC-seq 20
可视化 13
字符串处理 1
NGS 3
正则表达式 2
环境变量 2
网站搭建 1
Your browser is out-of-date!

Update your browser to view this website correctly. Update my browser now

×

最新文章
为什么M芯片的Mac不应该去装intel版的R

顺应时代吧
使用NextChat在本地使用Claude和ChatGPT

只需要3步
Helixer解决了我的基因组结构注释难题

这个模型太强了，强烈推荐
白话统计学习笔记：我们应该使用什么统计模型？

想清了问题，模型也就有了
动物如何准备pyscenic所需的cistarget数据库

非模式物种的动物还算简单
分类
其他 others
Linux linux
生信软件工具箱 biotools
R r
文章重现 reproduce
文献阅读 literature
数据结构与算法 algo
数据科学 data_science
基因组学 genome
转录组学 rna-seq
Python python
C++ cpp
Rust rust
Java java
基因调控 regulatory
标签
基因组注释 基因组注释
学习笔记 学习笔记
R r
其他 其他
Docker docker
容器 容器
统计学 统计学
随便 随便
GO go
Linux命令行 linux命令行
数据下载 数据下载
大语言模型 大语言模型
并行 并行
AWS aws
SRA sra
prompt engineer promptengineer
GPT gpt
HTS hts
h h
WSL wsl
环境配置 环境配置
hash hash
源码解读 源码解读
基因组 基因组
biocondutor biocondutor
Web开发 web开发
比较基因组学 比较基因组学
系统发育 系统发育
conda conda
深度学习 深度学习
自然语言 自然语言
随笔 随笔
SSH ssh
MacOS macos
读书 读书
编程语言 编程语言
MSVC msvc
MSCV mscv
QT qt
小技巧 小技巧
爬虫 爬虫
MAKER maker
typora typora
BioNano bionano
PBMC pbmc
数据挖掘 data_mining
算法 algorithnm
C/C++ c
遗传定位 mapping
Zotero zotero
文献 paper
坚果云 jianguo_cloud
服务器 server
基因家族 gene_family
JCVI jcvi
CIRCOS circos
序列比对 alignment
samtools samtools
流程工具 pipeline
Hi-C hi-c
注释 annotation
重复序列 repeat
TCGA tcga
差异分析 DGE_analysis
单细胞 singlecell
Perl perl
软件安装 software-installation
转录组 transcriptome
水稻 rice
GitHub github
组装 assembly
ChIP-seq chip-seq
数据结构 data_structure
表观组 epigenomics
Seurat seurat
BigWig bigwig
ATAC-seq atac-seq
可视化 visualization
字符串处理 strings-process
NGS ngs
正则表达式 regrex
环境变量 environment-variable
网站搭建 website-build