使用OrthoMCL鉴定直系同源基因组

OrthoMCL是目前最常用的基因家族分析软件,从2013年发布2.0版本之后再也没有更新过,虽然它的安装过程复杂负责,但是依旧挡不住大家对他的喜好。

「JCVI教程」使用JCVI根据CDS的BLAST结果绘制共线性图

利用CDS相互之间的blast结果展示基因组之间的共线性关系

「JCVI教程」使用JCVI进行基因组共线性分析(中)

JCVI的进阶用法,展示三个基因组之间的共线性关系

使用Swiss-Prot根据同源基因进行注释

使用UniProt上的dat信息对基因进行功能注释

Seurat的scATAC-seq分析流程

利用scRNA-seq的分析结果对scATAC-seq进行预测

为ChIPseeker增加了一个subset函数

做了一点小工作

三代组装软件miniasm笔记

这套策略也就是小基因组了
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