使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第六章)

这一章或许是大家最喜欢一章,因为可以展示之前聚类结果了

使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第五章)

降维之后的聚类就变得简单了

使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第四章)

scATAC-seq的降维真的不一般

使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第三章)

如何构建一个ArchRProject对象,并从中提取数据

使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第二章)

鉴定scATAC-seq数据中doublet

使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第一章)

对ArchR的基本介绍,以及如何从fragment.tsv.gz中创建Arrow文件

使用SCALE分析单细胞ATAC-seq数据

使用SCALE分析单细胞ATAC-seq数据

Cicero: 单细胞共开放分析

真的是一个比较复杂的工具

motifmatchr: 在R语言中分析peak中里是否有motif匹配

有些时候就想简简单单判断已有的motif是不是在我的peak里

「文章重现」2019发表在NBT的10x sc-ATAC-seq分析重现

数据量真大,20w个细胞,每个细胞成本要0.4美元
Your browser is out-of-date!

Update your browser to view this website correctly. Update my browser now

×