如何用binmapr进行遗传定位

binmapr是我折腾的一个R包,它能够将NGS测序得到SNP数据基于binmap进行纠错,用于更好的遗传定位。

为ChIPseeker增加了一个subset函数

做了一点小工作

样本足够多时别用DESeq2,用非参数检验都行

在样本量比较小的时候,用复杂的模型是无奈之举,它有很多假设成分在,尤其是你还想从无重复的实验设计中算p值。当你样本量够多的时候,用最简单的模型其实就会有很好的结果。

R语言的稀疏矩阵学习记录

有些时候还得靠自己写函数

实现Seurat 2 和 Seurat3 在同一个环境下共存

其实,我们可以通过修改别人的R包而构建一个自己用的R包

用rtracklayer读取和输出BigWig

自己写代码实现BigWig的输出

R语言的字符串操作

自带的处理方式和更好用的stringr
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